在造血干细胞移植过程中，确保受体的安全是首要任务。血小板的水平至关重要，通常应保持在20×109/L以上，对于有出血风险或需要实施侵入性操作的情况，血小板数量应提升至50×109/L以上。血红蛋白水平也需维持在70g/L以上，以支持受体的正常生理功能。最佳的输血策略是采用成分输血，这样可以更精确地补充所需的血液成分。
为了防止输血后发生的移植物抗宿主病（GvHD），所有血制品在输入前必须进行处理。一般采用放射灭活技术（15-20Gy）以消除T淋巴细胞，或者通过白细胞过滤器去除淋巴细胞，这样做不仅可以避免由白细胞引发的输血反应，还能降低巨细胞病毒感染的风险。
对于ABO血型不符的患者，如果血型差异较小，可以选择供者型或O型红细胞和受者型血小板，直到血型逐渐转化为供者型。在血型严重不合的情况下，可以先输入受者型红细胞和供者型血小板，直至血型转变，或者全部使用O型红细胞和AB型血小板。对于血型差异较大的患者，输注O型红细胞和AB型血小板是适用的策略。
造血干细胞移植(HSCT)是通过大剂量放化疗预处理，清除受者体内的肿瘤或异常细胞，再将自体或异体造血干细胞移植给受者，使受者重建正常造血及免疫系统。目前广泛应用于恶性血液病、非恶性难治性血液病、遗传性疾病和某些实体瘤治疗，并获得了较好的疗效。