兰花茎腐病用甲基托布津干粉撒盘土表面的治疗方法效果不大。
在确认兰花已感染茎腐病时，要立刻脱盆起苗，然后切掉染病的兰花苗，一直切到白色的组织位置，每切一次，工具都要进行杀菌消毒一次，同时要把死根、空根清理干净，如果不清理干净，这些根系里面的镰刀菌还会继续侵染健康的兰株，且在根系内的镰刀菌还不容易被药物杀灭，镰刀菌被隐藏在坏根的内部，因为死根药液无法进入。
常用的杀菌药有多菌灵、百菌清、甲基托布津、恶霉灵、世高、适乐时、敌力脱、奥美灵、阿米西达等。
把切除染病兰苗的健康兰株浸泡在稀释后的杀菌药中，药液要覆盖过假鳞茎，浸泡时间为30分钟或更长些时间。浸泡后拿出放到通风阴凉的地方阴干，根表面无水时应该对伤口进行封口，封口可用药物或蜡烛等方式进行，封口后便可重新上盆。
在兰花感染茎腐病时用的盆和植料最好丢弃，如舍不得丢，一定要进行杀菌处理，优先选择蒸煮的方式进行杀菌处理，高温下病菌会被全部杀灭，杀菌的同时还能杀灭虫卵，这样比较彻底，不方便蒸煮的就用杀菌药物浸泡，浸泡时间建议24小时以上，期间可以反复搅拌几次，让药物尽量进入到植料的死角。
在夏季一定要注意兰花放置地点的通风，良好的通风可以有效降低茎腐病的发生率，适当减少浇水次数或者适当延长浇水时间间隔，还要定期给兰花喷洒杀菌杀虫药，杀菌药可7-15天使用1-2次，杀虫剂15-30天使用1-2次。
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