1，所属范围不同，正科级是个统称，正科级是一个领导职务，主任科员是正科级职务下的一个领导名称。
2，领导职务的不同，主任科员属于正科级，但属于非领导职务，所以职位略低于现任科长、乡镇长等实职的正科级领导职务。
3，工资不同，职务工资上有区别，实职正科级略高于主任科员。各省职务工资规定不同，一般同一年参加工作的正科级领导职务和非领导职务的职务工资相差30至100元不等。
根据《公务员法》：公务员职务分为领导职务和非领导职务。
领导职务层次分为：国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。
非领导职务层次在厅局级以下设置。
综合管理类的非领导职务分为：巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员、科员、办事员。
扩展资料：
正科级指国家公职人员的行政职务级别，是最基层的领导层级。国家部级机关下设司局级、县处级、科级等层级。地方政府省、自治区下设地市级、县区级、乡镇（街道）级等，其中乡镇（街道）级与国家机关科级为平级单位。
同时，有些企业的管理部门也按处、科等称谓设置，但其并不对应相应的行政级别，也与国家机关或政府部门的相应职位的待遇无关。
有的机关（行政级别较高的）部门中，不担任领导职务的职员，按行政级别，享受正科级待遇，通常也被任命为主任科员（或副主任科员）。
参考资料来源：百度百科——正科级
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