由于在人群中很难找到HLA完全一致的供受者，因此，除同卵双生的器官移植外，其他同种异体组织或器官移植都会发生排斥反应。为提高移植成功率，减轻或延缓移植排斥反应，除了提高外科手术水平，防止感染外，主要措施是移植前组织配型和移植前、后免疫抑制疗法及各项免疫学与组织学指标的监测。
一、组织配型及交叉配合试验(crossmatching)
组织配型包括ABO血型配合和HLA配型筛选适宜的供受者。①ABO血型配合可防止超急性排斥反应。②HLA配型，Ⅰ、Ⅱ类抗原匹配数越多移植后存活时间越长。HLAⅡ类抗原的检测，近年来采用PCR的方法直接检测HLA\|DR、DQ、DP等位抗原可以更仔细的提供分子组织分型。
检测受者血清中有无抗供者MHC抗原或E-M抗原的抗体。应阴性才能移植，否则有发生超急性排斥反应的危险。这是常规必须进行检测的方法。
二、免疫抑制疗法
主要是使用X线照射，免疫抑制剂、抗T细胞血清等降低受者T细胞活性或除去一些T细胞，从而减弱受者移植物的免疫应答，延缓或减轻移植排斥反应。
（一）全身淋巴组织照射（total lymphoid irradiation,TLI）
将非淋巴组织和骨髓用防辐射材料遮蔽，用X线反复照射淋巴结、脾脏及胸腺。结果不仅可清除T细胞，而且可使免疫状态与胎儿或新生儿相似，并易于诱导免疫耐受。骨髓移植后可产生基因嵌合体细胞，这类细胞不仅不被排斥，而且也不发生GVHR。动物实验证明可抑制细胞和体液免疫应答。
（二）免疫抑制剂
1．抗体
抗CD3单抗或抗T细胞表面抗原或胸腺细胞多克隆抗体，在补体和吞噬细胞的参与下，溶解和清除T细胞。在同种异体骨髓移植前，处理供者骨髓细胞，清除成熟的T细胞，对防止GVHR非常必要。近来也用于防止肾移植急性排斥反应和逆转急性排斥有显著效果。另外用抗IL-2R P55亚单位的抗体，阻止IL-2与IL-2R结合，从而抑制了T细胞的活化，但并不溶解和消除T细胞。由于所用抗体均系动物来源，可使受者致敏。同时初次使用抗CD3，开始也可引起T细胞活化释放IL-2、TNF和IFN等细胞因子，引起寒战，发热、重者可出现支气管痉挛，甚至肺水肿。
2．免疫抑制药物
近年研究发展很快，有皮质类固醇、硫唑嘌呤、环孢素A、FK-506、雷帕霉素（rapamycin）等。
环孢霉素A(cyclosporine A, CsA)是真菌多孢木霉菌（Trichoderma ployporum）产生的含11个氨基酸残基的环状肽。主要抑制包括IL-2在内的细胞因子和对TD-Ag的初次应答。CsA对嗜环素（cyclophilin）有特别的亲合力，后者是一种异构酶，它催化活化的转录因子适当折叠。当CsA与嗜环素结合后，阻断嗜环素的酶活性，因而抑制某些基因的转录，特别是IL-2基因转录被抑制使IL-2缺乏，影响T细胞的克隆扩大、其他细胞因子的产生及B细胞生长等也受到影响。CsA是当前常用的免疫抑制药。
FK-506是从土壤中的“筑链霉菌”(streptomyces tsukubaepsis)培养物中分离的免疫抑制剂。结构与CsA不同，但免疫抑制作用相似，效力更强。主要是抑制TH细胞释放IL-2、IL-4和IFN的作用比CsA强100倍。能抑制同种异型反应性T细胞表达IL-2受体，还可抑制抗体生成。FK506有亲肝作用可促进肝脏再生与修复。因此，是肝脏移植最佳免疫抑制剂。
其他如雷帕霉素（rapamycin）作用机制与CsA相同，但抑制抗体产生的能力比CsA强1000倍；在祖国医学中，亦有人报道雷公藤和雷公藤多甙。常用雷公滕根水氯仿提取物TⅡ，它可抑制PHA诱导的T细胞转化，抑制IL-2分泌和早期IL-2R表达。使用TⅡ代替硫唑嘌呤初步获得满意的效果。
关于移植排斥反应免疫学监测，虽然方法很多，但均无特异性，因此，目前仍用细针穿刺活检等方法。
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