小燕子与紫薇命运相连，多次相救，共同经历奇遇。在梁大人寿宴上，小燕子引起风波，市集重逢的紫薇找回了她的信物。小燕子邀请紫薇和金琐住进大杂院，一起卖艺，洋人班杰明对小燕子产生兴趣，引发误会。紫薇与小燕子结拜，紫薇讲述了自己的身世。小燕子提议紫薇直接去见乾隆，途中她意外受伤，乾隆大为震惊。紫薇和金琐寻找小燕子，乾隆和班杰明关心她的伤势，常寿太医和令妃也给予照料。
紫薇求助柳青柳红找寻小燕子，班杰明调查她的背景。皇后审问过程中，小燕子反抗，两人初次产生对立。乾隆和令妃负责照顾小燕子，她成为了假格格。皇后怀疑不断，小燕子在误会中戏弄了容嬷嬷，关系变得更加紧张。令妃警告冒充风险，小燕子的洗澡穿衣场面成为笑柄。在御花园，小燕子偶遇永琪等人，心中不安。令妃揭示身份，小燕子担忧自身安全。为销毁画像证据，小燕子吸引班杰明的注意。乾隆封小燕子为格格，她在庆典上不慎跌倒。入住漱芳斋，小燕子与宫中太监宫女互动，紫薇等人担心她的安危，得知即将举行祭天仪式。
祭天之日，小燕子成为“还珠格格”，紫薇感到震惊。尔康救出紫薇，她无意间泄露身世。紫薇和金琐在福家讲述往事，情节紧张。小燕子质疑祭天事件，要求查明真相，福家保护紫薇，尔康释放柳青兄妹。小燕子不满班杰明和永琪的态度，太监们以逗她开心缓解气氛。令妃提醒冒充风险，小燕子在皇宫中经历种种挑战，与乾隆、永琪等人的关系错综复杂。
由湖南卫视和琼瑶再度联手合拍的《新还珠格格》于2010年6月在北京开机。新版还珠格格共分三部，分别为：还珠格格之燕儿翩翩飞（第一部）、还珠格格之风儿阵阵吹（第二部）、还珠格格之人儿何处归（第三部）。2010年8月5日，湖南卫视公布了新还珠格格的大量定妆照。2011年7月13日，该剧在北京举行了发布会。新还珠格格于2011年7月16日开始在湖南卫视全球首播。随后，又在台湾、香港、北美等地区陆续上映。