001 云霄飞车杀人事件 (琴酒 、伏特加出场,工藤新一喝下药变小,拉开序幕)
128 黑暗组织10亿抢劫事件 (宫野明美死亡,黑衣组织浮出水面)
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 (灰原哀出场,说出药名是APTX4869)
176 与黑暗组织的再会(灰原篇)(皮斯克出场,任务:暗杀)
177 与黑暗组织的再会(柯南篇)(宫野志保第一次恢复,皮斯克知其身份)
178 与黑暗组织的再会(解决篇)(皮斯克被琴酒灭口,贝尔摩德出场
309 与黑暗组织的接触(交涉篇)(柯南得知组织在雇佣电脑工程师编写一个神秘的系统软件)
310 与黑暗组织的接触(追踪篇)(对板仓的日记进行详细研究,获得情报)
311 与黑暗组织的接触(决死篇)(追踪组织,险些被Gin发现。灰原哀对赤井秀一有感觉
345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件 (朱蒂、赤井、詹姆斯身份为FBI;贝尔摩德对柯南承诺:放弃雪莉;解释了286-288工藤新一NY事件的全部线索 288 工藤新一纽约事件(解决篇)(贝尔摩德扮杀人魔登场,赤井秀一对其进行追踪。兰知道秀一是FBI。结尾处,莎隆对有希子说:我也有我的angel了,为后来作铺垫) )
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者 (本堂瑛佑行事奇妙,引起柯南注意)
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星 (结尾提到贝尔摩德的口头禅
491 红与黑的碰撞 开端
492红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团(水无怜奈给朱蒂传递信息,组织派出一名代号为波本的成员专门调查雪莉。冲矢昴出场,灰原哀察觉出异样)
563 侦探团VS强盗团(骚乱)(朱蒂被卷入强盗案)
578 召唤危机的红色预兆(FBI在寻找秀一;冲矢昴也出现在米花大厦)
579 黑与13的暗示(疑似秀一的男子和冲矢昴同时出现,局势再次混乱,赤井之死遭疑) 580 紧迫黑色的时限(Kir被怀疑身份,琴酒准备让基安蒂狙击疑似秀一的人)
581 红色的摇摆目标(冲矢昴称组织为‘笨狼’,对柯南似乎很了解,言语中好像对柯南传递了某些信息似的;狙击失败,boss命令撤退)
借鉴一下资料
参考资料:http://baike.baidu.com/view/2295385.html?wtp=tt