获奖概况 根据2016年3月研究所官网显示，建所80年来，药物所共获得各类科研成果奖170余项，其中国家三大奖20项，全国科学大会奖等奖励21项，省部级奖90项。 部分国家级获奖 时间名称奖项类别1982年4月 肌肉松弛药氯甲左箭毒 国家技术发明奖 三等奖 1982年7月 吗啡镇痛作用部位及镇痛机制的研究 国家自然科学奖 二等奖 1982年7月 中草药活性成份的研究——十二种新有效成份的发现 国家自然科学奖 二等奖 1985年6月 镇痛消炎药3-乙酰乌头碱 国家技术发明奖 三等奖 1985年6月 橡胶防老剂D致癌性的动物实验研究 国家科学技术进步奖 三等奖 1987年12月 真性胆碱酯酶抑制剂新药——石杉碱甲（福定碱） 国家技术发明奖 二等奖 1988年12月 抗疟药磷酸咯啶 国家技术发明奖 四等奖 1990/08/11 植物抗癌成份美登素的全合成研究 国家自然科学奖 三等奖 1991年11月 二巯基丁二酸 国家科学技术进步奖 二等奖 1991年12月 羟甲芬太尼——一种新的高选择性μ阿片受体激动剂 国家自然科学奖 二等奖 1991年12月 脑内多巴胺神经系统与四氢原小檗碱同类物的药理作用关系 国家自然科学奖 三等奖 资料来源： 备注：详细获奖概况详见： 论文发表 根据2016年3月研究所官网显示，1998年以来，研究所累计发表论文3500余篇，其中SCI论文2811篇，2006年以来，影响因子大于3的累计660篇。发表的SCI论文和引用率连续七年保持全国科研机构前15名，位列全国药学院校和科研机构首位。
2014年，上海药物所全年共发表sci论文540篇，影响因子（if） 总数2310.889，总被引频次691次，（其中通讯作者272篇，影响因子总数1167.62，总被引频次294次），平均影响因子4.279，篇均被引频次1.28次/ 篇，影响因子5，以上的论文121篇、3以上的论文已达317篇，在GPCR、化学蛋白质组学研究、分析动力学模拟、新型结构、新技术研究方面取得重要突破，首次解析P2Y12与激动剂和拮抗剂复合物的晶体结构，为新型抗血栓药物的研发提供了重要基础，两篇论文于2014年5月1日同期在Nature刊出后即被新华社、路透社等国内外媒体报道。 项目承担 2014年，上海药物研究所共有在研项目425项，其中承担国家重大科技专项课题44项，主持（或承担） 国家重点基础研究发展计划（973计划） 和国家重大科学研究计划项目15项、承担（ 或参加） 课题8项，主持（或承担） 国家高技术研究发展计划（863计划） 项目5项，主持（或承担） 国家自然科学基金重点项目6项、面上项目73项、国家杰出青年科学基金项目8项、国家自然科学基金重大研究计划重点项目2项，主持（或承担） 中国科学院战略性先导科技专项课题1项，主持（或承担） 院重点部署项目2项，承担重点国际合作项目2项。 专利及其他 2014年，上海药物所共申请专利98项，共获专利授权40项，其中有国内专利33项，国外专利7项，获商标注册1项。 《Acta pharmacologica Sinica》 《Acta pharmacologica Sinica》（《中国药理学报》）创刊于2000年，月刊， 目前被PubMed收录， 被SCI收录，其研究领域为：药理学。是中国药理学及药学领域唯一被收录至科学引文索引（SCI） 的学术期刊，其影响因子（if） 为2.468。 《Asian Journal of Andrology》 《Asian Journal of Andrology》（《亚洲男科学杂志》）创刊年于1999年，是中国重要的洲际学会国际性会刊，影响因子为2.530，在国际男科学领域期刊排名第三，在国内临床医学领域SCI期刊榜排名第一。
此外，研究所还主办科普杂志《家庭用药》。
