第二个故事《相遇》，是以我国每一颗原子弹研究为背景的，讲了一个叫高远（张译）的科研人员，为完成保密任务，突然从女友面前消失，最终为国捐躯的故事。
故事中的高远选择了为国献身，他放弃了他生活中哪怕是过了三年没有任何联系依然感情深厚的女友，义无反顾的投入到了原子弹研制事业中去，以今天的眼光来看，这人简直没有人性。
但其实这并不是没有人性，而是在当时，他心中还拥有着另外一种完全不同的感情，那种对于自己生长的这片土地和国家的无法割舍的依恋和爱。所以他的选择是去研究中心，所以他的选择是失踪三年，所以他的选择是即便因为工作即将丧命也恪守保密原则。
在这个故事中，张译不愿承认自己就是任素汐要找的那个人后，任素汐对着他讲述着他们从相遇到相知的故事着实让人动容！
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那个年代，有很多这样的人，前赴后继、义无反顾的为国家做贡献而毫无怨言，比如两弹一星的所有科学家们，没有他们，我们第一代国防事业就没有根基，没有他们，就没有我们现在的生活。这个故事让人泪崩，伟大的情操让人久久不能平静，拍摄很细腻，感情很浓烈，看似很平静，仔细体会那种情感如波涛汹涌般让你难以平静，哭的最凶的一段，这是为了中国能够屹立于世界不被强有力的武器，为了全中国人民，这种舍身忘死，让人动容，反观现在社会的精致利己主义者，真的是天差地别。
我和我的祖国第二个故事相遇主要讲在1964年，由于原子弹研发工作保密度极高，同事之间也互不知姓名，在国防科技战线的科研工作者高远（张译饰）三年未与家人联系，后来因病离岗，在公交车上偶遇曾经的恋人方敏（任素汐饰）。
在国家大爱和情侣小爱之间，那一代科研工作者纷纷选择了前者，于是人生从此只有相遇，没有相聚的故事。
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创作背景
2018年12月24日，黄建新和导演陈凯歌接到影片创作任务。首先，创意团队从“普通人”的角度来确定创作理念。后来，陈凯歌确立了统一七层形象风格的标准：情感化和情感化。
黄建新、陈凯歌三次见面。在第二次会议上，他们决定拍摄不同于以往劳模和警察的小人物。这个想法得到了电影办公室的支持。在确定了航母、汶川地震等30多个事件后，导演黄建新和陈凯歌挑选了十几个事件，然后让参与拍摄的导演们选择。
在影片的创作中，导演陈凯歌、总制片人黄建新、总制片人傅若青共同确定了12个字——历史时刻、民族记忆、正面碰撞。正是这12个词在定义电影最本质的东西时起着主导作用。
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