1.河海大学校本部位于南京市鼓楼区清凉山北麓，占地800余亩,校本部平面图
设有：水文水资源学院，水利水电学院，港口海岸与近海工程学院，土木与交通学院，环境学院，能源与电气学院，计算机与信息学院，力学与材料学院，地球科学与工程学院，农业工程学院，海洋学院，理学院，商学院，公共管理学院，法学院，马克思主义学院，外国语学院，体育系，机电工程学院，物联网工程学院，企业管理学院。
2. 河海大学常州校区的前身为1986年成立的河海大学机械学院，1996年5月更名为河海大学常州分校，2000年6月更名为河海大学常州校区。常州校区是河海大学具有较完整办学功能的重要组成部分，是学校建设高水平特色研究型大学的重要力量。常州校区地处江苏省苏锡常经济高速发展地区，位于“千载读书地，现代创新城”常州国家级高新技术产业开发区，与常州市行政中心毗邻，占地436亩。
常州校区设有机电工程学院、物联网工程学院、企业管理学院和基础学部。现有水利机械、物联网技术与应用2个二级学科博士点，机械工程1个一级学科硕士点，材料加工工程、通信与信息系统、低碳经济等7个二级学科硕士点，机械工程、电子与通信工程、计算机技术、工业设计工程4个专业学位硕士研究生授权点，以及机械工程、物联网工程、会计学等15个本科专业。
3.江宁校区：江宁校区教学区位于南京市江宁开发区，占地面积863亩，学生生活区占地面积134亩，教职工住宅占地80亩，总面积1077亩。
4.河海大学文天学院位于安徽省马鞍山市，是经教育部批准设立的全日制普通本科独立学院，是教育部直属全国重点高校在安徽省创办的唯一一所独立学院。该校现设有水利工程系、土木工程系、电气信息工程系、机械工程系、经济管理系、艺术设计系（筹）、国际教育学院、基础教学部、思政部六系一院二部。开设29个本科专业，其中省级卓越工程师人才培养计划2项，省级特色专业1个，省级振兴计划项目4项，
