一、分支机构资格界定
1、分公司是否界定为所得税纳税人还是要根据三个方面来界定：
① 银行开设结算账户
② 立建立帐簿，编制财务会计报表独立计算盈亏。以上就是独立核算的要求，只要符合三个条件，税务一律按照独立的企业所得税纳税人来对待，不符合三个条件的分公司，才可以统一核算。
③ 公司如果符合企业所得税纳税人的三个条件，应该独立在当地缴纳企业所得税，符合减免政策的，可按规定的程序办理。
2、分公司一般是非独立核算的，所得税要由总公司统一缴纳。
一般是办理了分公司手续后，总公司持总公司和分公司的税务登记证件到总公司的主管税务机关去开汇总纳税证明，将证明交分公司所在地主管税务机关即可。
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二、独立核算分公司的税务处理
1、对于分公司等分支机构，只要符合独立核算的条件，应单独申报缴纳企业所得税，适用经营所在地的企业所得税税率。
2、计税时，分公司和总公司应分别适用所在经营地的适用税率。
3、分公司作为独立纳税人，经营期间形成的年度亏损在确定总公司的年度应税所得时不能抵减，其注销前形成的累计经营亏损在总公司账面反映为无法收回的其他应收款或应收账款
4、总机构、分支机构不在同一征收区域的商业企业，不论其何时开业，一律按属地原则征税。跨征收区域的商品调拨，按《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第四条“视同销售”处理。同一征收区域内的总机构、分支机构可以汇总纳税，也可分别纳税。
三、关于分公司的撤消
1、如果不是独立核算的话，不用注销，直接并入总公司，毕竟不独立核算的，只有现金、银行存款、票据的进出，涉及费用，不涉及成本、利润。
2、独立核算的，先提交国税局审查增值税及所得税，缴销发票，国税局出具报告后，提交地税局审查营业税、附加税、个税，缴销发票，地税局出具报告，以上该补交税金的补交，完成后，注销开户行，持这三项注销存根联去工商，进行工商注销，上缴公章。以后就是公安上缴法人章、财务章，质量监督局注销代码证。
分公司是不可能有独立法人地位的，但可以独立核算财务，所有收支单独记帐，单独在当地报税，总公司期末汇总分公司报表。
总公司收取分公司的管理费：由公司懂事会会议或公司章程来确定。总公司收不收取管理费用仅是你们公司内部的利润分配计算方式，因所得税要汇总计算，不会对整个公司所得税产生影响。
具体分录：视具体业务来做。总公司收取管理费用的分录建议做管理费用的内部冲销，或者挂其他应收应付等往来科目，总公司最好不要确定收入，否则又要多交一道流转税。
扩展资料：
独立核算的特点是:在管理上有独立的组织形式,具有一定数量的资金,在当地银行开户;独立进行经营活动,能同其他单位订立经济合同;独立计算盈亏,单独设置会计机构并配备会计人员,并有完整的会计工作组织体系.方便分公司自主经营.
分公司的纳税流程:分公司的流转税，必须在当地的税务机关核算缴纳，这个是流转税的基本原则。也就是到地税申报缴纳。现在基本上所有的城市国税地税申报都是网上申报，未开通网上申报的公司，可以凭借税务登记证（正本副本）营业执照，基本行开户许可证，基本行开户行信息等证件，到当地税务机关申请网上申报纳税。
分公司的所有税种的申报，都必须由总公司汇总，由总公司申报。非独立核算的分公司仅仅只是总公司的一个分支机构，相当于一个部门。一般情况下，如果分公司是个独立核算的群体，既有营业收入，又有支出，分公司虽小，但是五脏俱全。
这种情况下的分公司，从财政考核上考虑，相信很多企业领导人都会做出一个决定，总分公司财政独立，个子独立核算。独立核算下的分公司，需要向当地税务机关申报纳税。 在分公司成立之初，就可以凭借当即工商部门审批下来的分公司营业执照，总公司的营业执照等相关证件，到当地银行办理分公司基本行开户。
如果总分公司不在一个地级市，这时候的企业所得税的申报，则需根据跨区经营所得税申报原则进行申报，按照总公司所在地国税部门核准的分配比例，总公司分公司分别各自向当地所得税申报主管部门申报缴纳。
关于企业所得税的申报问题，如果总分公司在同一个地级市以内，那么无论总分公司是否独立核算，均由总公司汇总申报即可。
参考资料：百度百科——独立核算