法律分析：一、作用不同
有关部门单位是指办事直接的单位，相关部门单位是指办事的间接单位。如办营业执照工商局是直接单位，卫生局，环保局等等是相关单位。
二、意思不同
相关表示彼此关连，互相牵涉，有关表示有关系，关涉，涉及。相关的关系更紧密一些，有关的稍微松散一些。
三、范围不同
“有关单位”牵扯的很多，例如有关部门、有关单位、相关部门、有关方面，相当于古代的有司，是政府、宣传机构和媒体经常使用的一类词语，指与事件有关系的部门或组织。
在政府工作报告、声明或者新闻发布会中，并不会点名应该负责任的部门的名称，而是模糊得称为“有关部门”。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》
第十七条 基层人民法院管辖第一审民事案件，但本法另有规定的除外。
第十八条 中级人民法院管辖下列第一审民事案件：
(一)重大涉外案件;
(二)在本辖区有重大影响的案件;
(三)最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件。
第十九条 高级法院管辖
高级人民法院管辖在本辖区有重大影响的第一审民事案件。
第二十条 最高人民法院管辖下列第一审民事案件：
(一)在全国有重大影响的案件;
(二)认为应当由本院审理的案件。
第二十一条 对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖;被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。