法律分析：农村合作医疗在医院结账后在规定时间内是可以报销的。新型农村合作医疗报销流程
1、新型农村合作医疗参保患者须凭本人医疗卡、本人有效身份证（无身份证的凭户口簿），经确认身份后，在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。
2、在市外二级及二级以上公立医疗机构医院住院治疗的参保患者，应在出院后三个月内，由参保人或其家属带医药费用原始发票（复印件无效）、住院医药费用汇总明细清单、出院小结及门诊病历、患者身份证、医疗卡、户口簿、经办人身份证到区行政服务中心一楼14、15号新农合窗口报销医药费用。
3、特殊病种门诊报销可持二级及二级以上定点医疗机构出具的病历及有关检查、化验报告等相关资料及医疗机构证明书，以及《黄岩区新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》向新农合业管中心提出申请，经区新农合办审核批准后，其门诊医药费用（不包括支持疗法、辅助治疗或治疗其他疾病的医药费用）可以列入新农合基金的报销范围，按住院报销标准以年度为单位报销。
4、因意外伤害的住院患者，出院后还需提交由户口所在村（居)签字盖章的意外伤害引发的原因确认证明以及医院的病案记录。对于无法提供有效证明及记录的，不予受理。报销周期为经区行政服务中心一楼14、15号新农合窗口受理起30个工作日内完成，经新农合业管中心稽查人员调查、审核，属实后予以报销；责任由第三方负责的，不予报销；住院患者自己也承担部分责任的，凭协议书或相关证明到区行政服务中心一楼14、15号新农合窗口报销自己承担部分的医药费用。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》 第二十五条 国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。
城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。
享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。
不是，实行即时结报制度，以青岛市为例。
《青岛市新型农村合作医疗条例》对其有相应的规定：
第三十一条参合居民在本市行政区域内新型农村合作医疗定点医疗机构就诊，实行即时结报制度。参合居民支付自付部分后。
报销费用由定点医疗机构先行垫付，新型农村合作医疗经办机构定期予以结算。新型农村合作医疗经办机构可以提供必要的预付资金。
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扩展资料：
《青岛市新型农村合作医疗条例》相关法条：
第三十七条 定点医疗机构应当按照协议要求提供基本医疗服务；新型农村合作医疗经办机构应当按照协议约定与定点医疗机构结算医疗费用。
第三十八条定点医疗机构应当严格执行临床技术操作规范，控制医疗费用，做到合理检查、合理治疗、合理用药、合理收费。
定点医疗机构使用新型农村合作医疗报销药物目录外的药品或者实施诊疗项目目录外诊疗项目的，应当征得参合居民同意。
参考资料来源：/baike.baidu.com/item/%E9%9D%92%E5%B2%9B%E5%B8%82%E6%96%B0%E5%9E%8B%E5%86%9C%E6%9D%91%E5%90%88%E4%BD%9C%E5%8C%BB%E7%96%97%E6%9D%A1%E4%BE%8B/4140906"target="_blank"title="只支持选中一个链接时生效">百度百科-《青岛市新型农村合作医疗条例》