一、本质不同
1、免予起诉较接近未犯罪。
2、免于刑事处罚是认定了犯罪。
二、含义不同
1、免于指不被某种事物所涉及。
2、免予一般指上行机关对下行机关或者行政机关对公民的免予处罚。
三、意义不同
1、免于起诉是因为案件性质不恶劣且当事人有良好的认识并积极做出赔偿(或因年龄等其他因素),法庭认定其今后不会再次犯罪的。
2、免于刑事处罚是在满足了上面所诉当事人的表现外,法庭认为当事人的过错有相当的危害性但尚不构成较大危害时所做出的裁定。
参考资料来源:百度百科-免于刑事处罚
参考资料来源:百度百科-免予起诉