目前农村沼气池发酵原料主要有猪粪、奶牛粪、肉牛粪、骡马粪、作物秸秆等。根据各地原料资源对上述发酵原料进行合理的科学配比，是充分利用发酵原料达到沼气池产气快、产气率高、维持产气高峰时间长的重要技术措施。
沼气池发酵原料的配比主要是根据各种原料中的碳氮比（C/N）来决定。碳素是沼气细菌活动的能量来源，例如各种作物秸秆、杂草、树叶等；而氮素是合成细菌原生质的主要成分，例如人畜粪便等。这两种原料要进行合理的搭配，混合进料，才能获得较好的产气量。下面介绍几种发酵原料配比。
（1）以猪粪为主加玉米秸秆
猪粪C/N为13∶1，含氮较多，玉米秸秆C/N为53∶1，含碳素较多。一个10米3的沼气池，按沼气池发酵容积的80%计，各原料的配比应为：猪粪4米3，玉米秸秆400千克，接种物3米3，粪草比基本为2∶1，用稀人粪尿代替自来水。如没有人粪尿可加0.3%～0.5%碳酸氢铵或0.1%～0.3%尿素的水溶液，另加5千克石灰的水溶液。
（2）以牛粪为主加猪粪
鲜牛粪的C/N为25∶1，一个10米3的沼气池各原料配比应为牛粪3～4米3，猪粪2米3，接种物3米3，加人粪尿和少量石灰水溶液。若用牛粪加玉米秸秆作为发酵原料，要加5～10千克尿素和5千克石灰的水溶液，最好用人粪尿代替自来水，效果更佳。
（3）以玉米秸秆为主要发酵原料
用玉米秸秆作为沼气主要发酵原料虽然还没有推广，但有些用户一直在利用作物秸秆、杂草发酵，而且积累了不少经验。我们相信在不久的将来玉米秸秆会在沼气建设中发挥作用。