平阴县经济和信息化局（县商务局）设有七个职能科室，分工明确，各司其职：
办公室（兼人事科）：负责全局日常协调，制定和执行各项制度，包括文秘、档案、接待等工作。管理机关资产、财务，监督企业党建和党风廉政建设，以及组织人事管理和机构编制。
经济运行科：负责经济调控，监督工业生产，制定并执行经济指标计划，维护经济秩序，组织重要物资调度，管理电力和能源发展，参与项目审核和电力执法。
信息产业科：指导信息化建设，推进产业融合，管理电子信息制造业，推进软件服务外包，负责电子政务网络建设和信息安全保障。
规划与技术改造科：参与工业规划，指导企业技术改造，推动技术创新，负责重大项目管理，组织设备和标准化工作。
商贸服务管理科（附畜禽屠宰管理）：制定商贸发展战略，推进市场体系完善，负责农村市场和农产品流通，管理相关许可证和行业执法。
节约能源办公室：负责节约型社会建设和循环经济，推动资源节约，监督企业节能，执行淘汰落后产能，考核节能任务。
外经外贸科：执行外经贸政策，协调进出口事务，监督外商投资，制定年度目标，组织企业参与国内外贸易活动，提供指导和服务。
每个科室都承担着重要的职能，确保了平阴县经济和商务工作的高效运行。