电子商店订单处理主要包括订单准备、订单传递、订单登录、按订单供货、订单处理状态跟踪等活动。
具体流程为：
一、订单接受
接受订货的第一步是接收订单
1）公司统一配发 2） 客户订货 3）电子订货 4）订货系统
二、订单确认
1）确认所需货品、数量、交期 2）确认客户信用
核查客户的财务状况，一般是核查客户
应收帐款是否超过信用额度； 3）确认订单形态
一般交易、现金交易、间接交易、合约式交易、寄库存式交易； 4）确认订货价格
不同客户、不同数量，可能有不同的货物价格，在输入价格时应审查，若输入价格不符（输入错误或业务员降价强接单），应予以锁定，以便主管审核； 5）确认包装方式
客户所订货品，是否有特殊的包装、分包装、与贴标签要求，或有无易腐、或易湿物品在其中；
三、 建立客户档案
客户档案应包括：
客户名称、编号、等级；客户信用额度；
1、客户付款及
折扣率条件； 2、开发负责此客户的业务员资料； 3、客户的配送区域； 4、客户的收货地址； 5、客户配送路径的顺序； 6、客户所在地区适合的运输方式、车辆形态；7、客户点卸货特点； 8、客户配送要求； 9、延迟订单处理方式；
四、存货查询与订单分配
输入客户所订商品的名称、代码后，系统就查对存货档的资料，查看此商品有无缺货，如有缺货就提供商品资料有无替代品，或缺货有无采购还没入库信息；
订单输入确认无误后，最主要的就是将订单汇总、分类、调拨库存，订单分配方式可以单一订单分配或批次分配； 1、计算订单拣取时间
订单处理人员要事先计算每个订单或每批订单的可能拣取时间，以便有计划的安排出货先后顺序；
2、计算拣取每一个（一公斤、一个纸箱、一件）货物的标准时间，且将它设计于电脑记录标准拣取时间档，将此标准时间记录下来，就能方便的推算出整个的货物拣取时间；
3、有了拣取标准时间后，可依每个品种的订购数量（所耗时间）再配品项的寻找时间，计算出每个种类的拣取时间；
4、根据每一订单或每批订单的种类及考虑批订单的标准拣取时间算出； 5、依订单排定出货时间与拣货顺序
五、订单分配后存货不足处理
若公司存货不足不能满足客户需求时，客户又不接受替代品，则按客户的要求与公司规定有如下几种方法处理; 1、重新调拨
若客户不允许过期交货，公司不愿失去订单时，则有必要重新调拨分配订单； 2、补送
若客户允许不足部份可以等有货时再过期交货时，公司政策也允许，则采用补送处理；
若客户允许不足订单额的部份或整张订单留待下一次订货时配送的，也采用补送处理； 3、删除不足额订单
若客户不接受部份出货，或公司政策不希望分批出货时，则删除订单；若客户不接受过期出货，公司也无法再重新调拨时，则删除订单；
4、延迟交货 延迟交货分两种，
1）有时限延迟交货，客户允许在一段时间内过期交货，且希望所有订单一起送达，
2）无限延迟交货，客户允许不论延迟多久交货，希望所有订单一起送达，则等所有订货到后再一起配送；对延迟订单需要有记录存档或单独列项；
5、取消订单
若客户希望所有订单一起到达，且不允许延期交货，公司也无法再重新调拨，则取消订单；
6、订单资料输出
需要打印出的资料包括：拣货单（或拣货单条码）、缺货资料。
以上为订单处理所涉及到的方方面面，物流在订单执行过程中扮演及时、安全、足额配送的关键角色，并直面门店和终端客户， 也是了解客户需求与服务反馈的一个重要信息源。