首先是选址和土地手续。 需要在国土局和农业局备案签订用地协议，保险起见大规模的还要通过规划局的选址意见，预留好发展用地，避免后期扩建时变成“违规建筑”；好消息是国土资源部力挺养殖户，制定了《全国土地分类》和《关于养殖占地如何处理的请示》规定，把养殖用地划归为农业用地，用基本农田以外的耕地从事养殖业不再需要审批。
也就是说现在办理养殖场，饲养栏舍和绿化隔离带属于农用地，不用再去办理繁琐的农用地转用审批手续了。要注意的是用来管理、生活用房、疫病防控设施、饲料储存间、硬化的路面属于永久性建筑物，还是需要办理农用地转用审批手续的。禁养区之内就别想再搞成规模的养殖了，现在建成的手续齐全的都要搬迁，还是去偏远地区发展吧，四川、贵州、云南，、东北三省、内蒙古是不错的选择。
除了土地手续之外还要办理《动物防疫条件合格证》，没有这个证件是不能从事养殖业的。 今后还会需要养殖场内有具备执业兽医资格证等国家认定的畜牧类技术职称的人员才可以 ，可以是老板，也可以外聘，有就行。
环评手续很重要，要通过环保局的审批拿到环境影响审批意见和排污许可证，环评通不过以后会很麻烦，可能会被禁养，养殖场被拆除的情况都会发生。
动物防疫条件合格证审批下来后可以去工商局办理营业执照了，当然还要到畜牧局办理登记备案手续的。
国家近年对三农问题非常关注，不少地区还可以立项备案，立项成功是有补贴的。
拓展资料：
1. 选址和土地手续
需要在国土局和农业局备案签订用地协议，保险起见大规模的还要通过规划局的选址意见，预留好发展用地，避免后期扩建时变成“违规建筑”。
好消息是国土资源部力挺养殖户，制定了《全国土地分类》和《关于养殖占地如何处理的请示》规定，把养殖用地划归为农业用地，用基本农田以外的耕地从事养殖业不再需要审批。
也就是说现在办理养殖场，饲养栏舍和绿化隔离带属于农用地，不用再去办理繁琐的农用地转用审批手续了。
要注意的是用来管理、生活用房、疫病防控设施、饲料储存间、硬化的路面属于永久性建筑物，还是需要办理农用地转用审批手续的。
2. 注意是否禁养区
禁养区之内就别想再搞成规模的养殖了，现在建成的手续齐全的都要搬迁，还是去偏远地区发展吧，四川、贵州、云南、东北三省、内蒙古是不错的选择。
3. 动物防疫证明
除了土地手续之外还要办理《动物防疫条件合格证》，没有这个证件是不能从事养殖业的。
今后还会需要养殖场内有具备执业兽医资格证等国家认定的畜牧类技术职称的人员才可以，可以是老板，也可以外聘，有就行。
4. 环评手续
环评手续很重要，要通过环保局的审批拿到环境影响审批意见和排污许可证，环评通不过以后会很麻烦，可能会被禁养，养殖场被拆除的情况都会发生。
5. 营业执照
动物防疫条件合格证审批下来后可以去工商局办理营业执照了，当然还要到畜牧局办理登记备案手续的。
办理个体工商户营业执照需要提供材料：1、需要名称字号的，到当地工商所申请名称预先核准登记（携带本人身份证）；2、设立申请书，（到当地工商所领取）；3、经营者身份证明；4、经营场所证明。
如果走正常程序如下：
当地农村集体经济组织签订土地租用协议或意向协议。
1、视养殖场项目大小需向当地发改部门申请立项，出具可行性研究报告。
2、在当地农业（畜牧）部门办理相关生产手续
3、在当地环境部门办理环评手续，如污水处理设施建设等
4、办理相关立项手续后到当地国土部门办理设施农用地使用手续，签订或缴纳土地复垦费用。
布局符合动物防疫要求，生产区与生活区分开;
畜舍的设计、建筑符合动物防疫要求，采光、通风和污物、污水排放设施齐全。有患病动物隔离圈舍和病死动物、污水、污物无害化处理设施、设备，有专职人员;出入口应有隔离和消毒设施、防疫制度还要健全。
因为只有你手续不全了，才有可能被认定成违法建筑。其实耕地上的违法建筑主要是指一种情况，就是违法将农用地转为了建设用地。那么养殖业这块儿有点不一样。