分为三种情况，具体如下：
1、同一控制下控股合并：长期股权投资入账价值和支付资产账面价值差额（可以在借方，资本公积不足冲减的冲减留存收益）。
2、同一控制下吸收合并的，取得资产账面价值与支付资产账面价值的差额（该项于个别报表确认，差额可以在借方，资本公积不足冲减的冲减留存收益）。
3、非同一控制下吸收合并，调整被投资方资产和负债价值（由被投资方账面调整到公允价值），差额计入资本公积（此处资本公积指被投资方资本公积），如果考虑所得税，需要确认递延所得税，同时冲减确认的资本公积。
扩展资料：
资产公积会计处理
一、本科目核算企业收到投资者出资超出其在注册资本或股本中所占的份额以及直接计入所有者权益的利得和损失等。
二、本科目应当分别“资本溢价”或“股本溢价”、“可供出售金融资产”、“其它资本公积” 进行明细核算。
三、资本公积的主要账务处理
（一）企业收到投资者投入的资本，借记“银行存款”、“其他应收款”、“固定资产”、“无形资产”等科目，按其在注册资本或股本中所占份额，贷记“实收资本”或“股本”科目，按其差额，贷记本科目（资本溢价或股本溢价）。
与发行权益性证券直接相关的手续费、佣金等交易费用，借记本科目（股本溢价），贷记“银行存款”等科目。
公司发行的可转换公司债券按规定转为股本时，应按“长期债券——可转换公司债券”科目余额，借记“长期债券——可转换公司债券，按本科目（其他资本公积）中属于该项可转换公司债券的权益成份的金额，借记本科目（其他资本公积）。
按股票面值和转换的股数计算的股票面值总额，贷记“股本”科目，按实际用现金支付的不可转换为股票的部分，贷记“现金”等科目，按其差额，贷记本科目（股本溢价）科目。
企业将重组债务转为资本的，应按重组债务的账面价值，借记“应付账款”等科目，按债权人放弃债权而享有本企业股份的面值总额，贷记“股本”科目，按股份的公允价值总额与相应的实收资本或股本之间的差额。
贷记或借记本科目（资本溢价或股本溢价），按重组债务的账面价值与股份的公允价值总额之间的差额，贷记“营业外收入——债务重组利得”科目。
企业经股东大会或类似机构决议，用资本公积转增资本，借记本科目（资本溢价或股本溢价），贷记“实收资本”或“股本”科目。
（二）企业的长期股权投资采用权益法核算的，在持股比例不变的情况下，被投资单位除净损益以外所有者权益的其他变动，企业按持股比例计算应享有的份额，借记“长期股权投资——所有者权益其他变动”科目，贷记本科目（其他资本公积）。
（三）企业以权益结算的股份支付换取职工或其他方提供服务的，应按权益工具授予日的公允价值，借记“管理费用”等相关成本费用科目，贷记本科目（其他资本公积）。
在行权日，应按实际行权的权益工具数量计算确定的金额，借记本科目（其他资本公积），按计入实收资本或股本的金额。
参考资料来源：百度百科--资本公积
同一控制下吸收合并的，取得资产账面价值与支付资产账面价值的差额（该项于个别报表确认，差额可以在借方，资本公积不足冲减的冲减留存收益）
非同一控制下吸收合并，调整被投资方资产和负债价值（由被投资方账面调整到公允价值），差额计入资本公积（此处资本公积指被投资方资本公积），如果考虑所得税，需要确认递延所得税，同时冲减确认的资本公积。