1、法律规定不同。依据国家法律，宅基地不能上市交易，所以宅基地证不能过户。而房产是可以进行市场交易的所以房产证可以过户。
2土地性质不同。土地的获取方式不同。土地的发证机关也不一样。
农村宅基地使用权是归农民个人所有，为了更好的保护农民的权益，国家开展了农村宅基地确权的认证。
农村宅基地产权确权证书与房产证有何区别
1、农村宅基地的产权确权证书，实际上确认的是农民所享有的农村宅基地的使用权而不是所有权，因为农民只是对宅基地上的房屋拥有所有权，对于宅基地只有使用权，宅基地的使用权归农民，所有权归集体经济组织所有即国家所有。而房产证是购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。即《房屋所有权证》，是国家依法保护房屋所有权的合法凭证。房屋所有者凭证管理和使用自己的房屋。房产证包括房屋所有权证和房屋共有权证，在通常意义上，房产证是房屋所有权证的简称，是由不动产登记机关发放的证明房屋所有权归属的书面凭证。与农村宅基地的确权证书是不一样的
2、拥有的房产证就拥有了对房屋处分的权利，可以进行普通商品房买卖，买卖人口的性质不受限制。但是农村宅基地即使有确权证书，也只能是在集体经济组织内部进行买卖，不能买卖给城镇人口，且买卖的只是宅基地的使用权，买卖后不能再申请新的宅基地。
3、我国宅基地是以“户”为单位发放的，而“户”是家庭成员的集合体。在各省制定的宅基地管理法规中，基本都确定了发放、审批宅基地的条件是以“子女结婚确需要分户”和“外来人口在本集体组织落户”等为基本条件。在一户中，最基本的家庭成员往往有夫妻、父母子女甚至还有其他人员。而城市房产证则目前没有限制，只是一些一、二线城市在限制，一般情况是根据经济情况购买房屋。
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