地铁用手机直接扫码通过的方式有支付宝、微信和云闪付支付。
1、支付宝。首先打开支付宝软件，进入到首页后，选择出行服务。然后选择左上角上面的城市，定位到自己所在的城市。当看到选项之后，再去选择地铁。然后需要选择领取地铁交通卡，确认授权协议书以及免密支付等事项后，再去选择协议书，选择同意协议并领卡。当完成授权后，再去选择立即使用，就能看到乘坐地铁的乘车码。
2、微信。打开手机微信软件之后，然后选择我的，再去点击服务。然后需要找到交通出行板块里面的出行服务，等到页面成功跳转之后，就可以看到公交卡、地铁卡、乘车码。如果并没有自动跳转到所在的城市，就需要点击左上角上面的城市，然后再去选择开通乘车码。等到开通之后，就能看到乘坐地铁的二维码。
3、云闪付。首先下载一个云闪付app，等到下载完成后打开云闪付app。选择左下角位置的收付款，直接把自己的付款码放在机器下面进行扫描，当听到扫码成功，也就意味着已经完成支付。如果手机有nfc功能，操作就会更加简单，只需要选择底部位置的享优惠，然后选择生活便利里面的碰一碰，只需要打开碰一碰付款后，等到乘坐地铁期间把手机跟支付终点设备靠近即可。
手机扫码乘坐地铁的便利之处
1、可减少货币的流通、零钱的使用。刷手机坐地铁有利于解决乘客坐地铁没有合适的零钱、零钱携带不便的尴尬情况。大大有利于乘客的出行。
2、可以减少买票程序。对于人口较大、人口流动性强的大城市，如果刷手机坐地铁的话，只需用手里的手机轻轻一刷提前在网上买好的票，就能顺利买上票坐上地铁，大大降低了乘客们购买的时间。
3、操作更简单化。刷手机坐地铁只需提前在网上订票、再到现场去取票两步，就能简洁快速地取到票，尤其对于那些第一次坐地铁不知道怎么操作买票的乘客来说，这简单的两步步骤，简单易学，通俗易懂，为广大乘客提供了最大程度上的便利。