执业药师和主管药师分别属于不同领域，在卫生系统主管药师属于中级职称，在药监系统执业药师是执业资格。从层次上加讲二者应该是一个档次。
两个考试侧重点是不一样的，执业药师比较各科均衡，考得非常全面，试卷紧扣大纲，虽然题目难度不大但非常提出的非常全面，必须要全面复习不可放掉每一个大纲上的细节。
主管药师就不一样了，考点主要就是药理、药剂和一点点法规。其他都不考，尤其是真正意义的药分比如化学分析、仪器分析的根本没有。只要把医院药学这块搞明白就全搞定了。
相较之下，对于大多数考生而言，执业药师考试难度要略高于主管药师考试。
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