南京不同的地铁线路最早运行时间是不同的。一般来讲是从早晨到5:40~6:00之间就会发出首班车。例如南京地铁1号地铁线迈皋桥站，便是早晨的5:42。而地铁2号线、地铁3号线，早上的第一班车全部都是6点发车。
南京地铁运营时间
南京共27条地铁线路，462个站点(含规划)，线路分别为地铁10号线、地铁1号线、地铁2号线、地铁3号线、地铁4号线、地铁S1号线、地铁S3号线、地铁S7号线、地铁S8号线、地铁S9号线、地铁13号线、地铁S8号线南延、地铁3号线三期、地铁S2号线、地铁S5号线、地铁10号线二期、地铁11号线、地铁9号线、地铁5号线、地铁S6号线、地铁S4号线、地铁8号线、地铁4号线二期、地铁7号线、地铁12号线、地铁6号线、地铁7号线南段。