22问答网
所有问题
当前搜索:
RNAseq所需RNA的量
血浆样本进行
rna
-
seq需要
注意些什么
答:
血浆样本中
RNA的
含量较低,不容易获取,一般BIOG血浆核酸提取方法得率5-15ng/ul*50ul,这个量对于RNA-
seq
可能会稍有点低,可以采用BIOG游离核酸富集方法,相当于浓缩核酸的过程,测序一般至少1ug以上。
RNA
-
seq
分析之我见(一)
答:
编码
RNA
:根据中心法则我们知道,DNA转录为mRNA,mRNA通过tRNA翻译为蛋白质,蛋白质行使生命功能,例如呼吸,运动,消化等等。人类只有2万左右个蛋白质编码基因,这些编码基因只占人类全基因组的2%左右。mRNA占细胞RNA总量的2%~5%, tRNA占细胞RNA总量的15%左右。非编码RNA:有些DNA转录为RNA后,不继续编码...
正常的转录组测序包含小
rna
吗
答:
有专门针对小
RNA
进行测序的,采用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率水平的数百万条小RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因。转录组测序的方法很多,而RNA-
seq
是当前转录组测序的一种测序方法,又称为二代测序,包括454,solexa等。RNA-seq即转录组...
01高通量测序-
RNA
-
Seq
简介
答:
最简单的方法就是用每个基因的reads除以每个样本的总reads。然而,还有许多更复杂的方法可以做到这一点。我们需要一张有20,000个轴的图表来绘制原始数据,所以我们使用PCA(主成分分析)或者类似的方法来绘制这些数据。PCA减少了显示数据重要方面
所需的
轴数。这是一个在神经细胞上做的
RNA
-
seq
实验的PCA图。...
细胞样品做
rna seq
,一定要重复吗
答:
最好做一下重复,才具有统计学意义。测序策略:PE100或PE125 建议数据量:
真核生物: 一般测序:5~6Gb 深度测序:10Gb
原核生物: 一般测序:1Gb 深度测序:5~10Gb
转录组学基础——什么是
RNA
-
seq
答:
RNA-
Seq
开始于
RNA的
抽取和纯化。接着,通常会使用一种叫作逆转录的过程将RNA转化为cDNA。为了能够进行测序,cDNA会被切割成更小的片段。这些片段随后通过一台测序机器进行测序,通常产生数百万到数十亿的短序列读取,称为“reads”。随后,这些reads会被比对到一个参考基因组或者组装成转录本。RNA-Seq的...
2021-04-09
RNA
测序深度的选择
答:
RNA
-
seq
测序深度 大多数实验每个样本
需要
5–200 M reads,具体取决于生物体的复杂度和大小。(1)快速检测高表达基因的基因表达谱实验,每个样本可能只需要5–25 M reads。(2)研究方向是获取更全面的基因表达总体信息及一些可变剪切相关的实验,通常每个样本需要30–60 M reads。(3)若要深度研究...
rna
-
seq
一般多少m reads
答:
按照PE150计算的话,30M的数据量为:30x150x2=9000M≈9G
RNAseq
、转录组测序?
视频时间 00:57
RNA
-
seq
名词解释(1)
答:
RNA
-
seq
,即转录组测序技术,利用高通量测序方法分析mRNA、smallRNA、noncodingRNA等RNA分子的表达水平。这项技术常用于识别差异表达基因(DEG)。转录组是指一个生物体或特定细胞类型产生的所有转录本的集合。研究转录组能够从整体上分析基因功能和结构,揭示生物学过程和疾病发生中的分子机制,并在基础研究...
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜
RNAseq分析
怎么分析RNAseq
做RNAseq结果不稳定
分析RNAseq用什么软件
RNAseq与芯片
所需量怎么算
每日所需液体量
正常人每日所需液体量
所需药物量