22问答网
所有问题
当前搜索:
illumina测序仪
建库
测序
中的若干问题(1)
答:
Illumina 测序仪
在收集信号时,并不是拍摄一张彩色照片一次完成的,而是分 A、C、G、T 4 个波长,分别拍摄 4 张单色照片,然后通过软件处理把这 4 张图叠加成一张。这是一种权宜之计,目的是减少图片文件的大小,从而降低对于数据存贮空间的要求。但也有缺点,...
二代
测序
fastq序列名称格式(
illumina
NGS)
答:
在fastq文件里,会用4行文本来表示一条序列:在fastq文件里,会用4行文本来表示一条序列:其中第一行文本是序列的名称(read name 或者说read ID),包含了非常多有用的关键信息,每部分信息之间用 ':' 分隔开,从左到右依次看过去:SIM 表示 instrument ID(即
测序仪
的硬件ID)1 表示 run number...
【临检杂谈】---临床检测,到底该选PCR还是NGS?(一)
答:
大家开始心有灵犀的搞靶向测序,甚至还有白嫖的(数据挖掘)。 这第三阶段的,我以2013年为分水岭,因为这一年罗氏关闭了454测序业务,454焦磷酸
测序仪
逐步退出市场。 同样在2013年,
Illumina
收购了Verinata Health 、Advanced Liquid Logic、NextBio三家公司。这三家公司专注的技术领域分别为繁殖和...
01高通量
测序
-RNA-Seq简介
答:
我们可以使用RNA-Seq去检测正常细胞和突变的细胞中的基因表达。然后我们就可以比较这两种细胞类型,在突变细胞中找出它们的不同之处。RNA-Seq分三个主要的步骤:注意 :我使用
Illumina
协议(protocol)和
测序仪
(sequencer) 作为我的例子,因为他们是常用的,但记住,有其他协议和测序仪是不同的。我们这样做...
基因检测有哪些方法
答:
第二代:高通量测序(NGS)第二代测序技术的优点是测序通量和效率高,成本低廉;缺点是测序读长普遍较短,且用时较长。以目前应用最为广泛的
测序仪
之一的
illumina
公司Hiseq2000测序仪为例,其一次测序的数据产出量可达500 Gb,但读长为100 bp,且需要耗时14天左右。而Life technology公司的IonProton测序...
单端
测序
与双末端测序问题
答:
再把环化后的DNA分子打断成400-600 bp的片段并通过带有链亲和霉素的磁珠把那些带有生物素标记的片段捕获。这些捕获的片段再经末端修饰和加上特定接头后建成mate-pair文库,然后上机测序。主要原因在于
Illumina
的二代
测序仪
的读长短,相对于第一代sanger测序法(约1000bp)或者跟同属于NGS的其他测序仪相比短...
现有的
测序
技术有哪些,技术原理和应用有哪些。
答:
第一代测序:以ABI公司为代表的sanger测序,
测序仪
为3730.原理是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种带有荧光标记的终止核苷酸为止,通过捕获荧光来进行分析,最后得到一系列的峰图,分析可得知其序列。第二代测序就多了,罗氏为代表的454测序,
illumina
的solexa测序以及ABI的...
如何看待大数据基因的问题
答:
1. 海量数据的产生 刚过去的七八年间,我们储存的个人基因组数据量已达到106规模,这个数量如此惊人,且这只是刚刚开始。每年
Illumina
公司的HiSeq X 10
测序仪
已经可以完成超过18000人的基因组测序工作,该测序系统已分布在全球顶尖测序中心,每天产生大量的数据。英国2014年也启动了“十万人基因组计划”,...
NGS接头详解
答:
b) 激光平衡(必须考虑) :是指在一组Index序列中需满足每个碱基位A + C =G + T,在
Illumina测序仪
中,A和C两种碱基共用一种激光,由波长660nm的红激光激发;G和T共用一种激光,由波长532 nm的绿激光激发。需要说明的是激光平衡是在碱基不平衡的情况下的无奈之举,在一定程度上可以提高index测序...
转录组分析(3) - 质量控制
答:
碱基的合成依靠的是化学反应,这使得碱基链可以不断地从5'端一直往3'端合成并延伸下去。 但在这个合成的过程中随着合成链的增长,DNA聚合酶的效率会不断下降,特异性也开始变差,这就会带来一个问题——越到后面碱基合成的错误率就会越高 ;有时候
测序仪
在刚开始进行合成反应的时候也会由于反应还不够...
<涓婁竴椤
1
2
3
4
5
6
7
8
涓嬩竴椤
其他人还搜