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illumina测序仪
如何评价华大推出的BGISEQ-500
答:
准确度按照官方的话说应该是“unbelievable accuracy”,大概错误率是1E-6这个级别,显然是比任何面试的
测序仪
正确率都远远要高。但是请不要忽略了CG这台测序仪的读长只有28bp,而请考虑把
illumina
的读长从250bp和150bp砍到28bp再比较正确率的情况。3.1 先说优势。数据产量巨大,因而单位成本一定很低...
二代测序建库试剂盒可以在不同
测序仪
用吗
答:
可以在同一个平台上用,但是不能跨平台比如
illumina
的不能用到life上
Illumina
Hiseq/Miseq
测序
原理简介
答:
Single-read sequencing(SR,单端测序)−只检测基因片段一段的基因信息。c)混 样 测 序 Index Sequencing:将多种样本混合测序 −充分利用solexa高通量测序特点。A:Adapter B:Fragment DNA C:Index seq primer D:Index E:Adapter 五、仪 器 构 造 1)Miseq
测序仪
六.测序结果...
华大
测序仪
原理
答:
探针结合后洗去未结合的探针,然后检测应该信号,得到序列信息。然后移除所有的结合探针和锚序列,开始下一轮
测序
。对比
ILLUMINA
的 SBS 测序,优点是下一个碱基不依赖于上一碱基,这样测序错误更加随机。后来的 BGISEQ-500
仪器
使用改进自 cPAL 的 cPAS(combinatorial probe-anchor synthesis) 技术,具体...
[
测序仪
原理] 二代测序:边合成边测序-高通量和大数据的第一扇门(2):焦...
答:
揭秘焦磷酸
测序
:高通量与大数据的前沿技术(2)焦磷酸测序,一个引领二代测序革命的关键技术,以QIAGEN的PyroMark和罗氏的454测序系统为代表,为我们揭示了基因组数据的全新解读方式。不同于
Illumina
的荧光标记dNTP,焦磷酸测序利用的是PCR扩增过程中dNTP释放的焦磷酸分子(ppi)。其中,PyroMark的步骤巧妙而...
FASTQ文件格式及
测序
文件phred质量格式判断
答:
Fastq格式是一种基于文本的存储生物序列和对应碱基(或氨基酸)质量的文件格式。下面是一个
Illumina
平台测序的真实数据,其中包含了1条reads的信息。FASTQ格式储存的序列信息,每1条reads的信息,可以分成4行。在
测序仪
进行测序的时候,会自动根据荧光信号的强弱给出一个参考的测序错误概率(error probility,...
Pacbio
测序
(一)
答:
Pabio主要发布三个
测序仪
,RSII实体比较大,Sequel平台在节约了大量的光学检测部件的空间以后,原来外置的数据处理器Blade Center与主机合二为一,内置于下部空间,成为一个整体,其体积减小至只有原来的1/3。相对于
Illumina
Hiseq的体积也小11%。重量也从过去的一吨多到现在的不足400kg。相比之下,...
科普讲堂 | 一代、二代、三代基因
测序
技术大对比
答:
Illumina 原理: 桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。主要步骤:1、DNA文库制备——超声打断加接头;2、Flowcell——吸附流动DNA片段;3、桥式PCR扩增与变性——放大信号;4、测序——测序碱基转化为光学信号。二代测序技术虽然通量很高,成本低廉,但是读长实在太短,主流的
Illumina测序仪
,常规模式只能...
在基应
测序
文献中出现的reads单词
答:
第二代核酸测序基本上都是采用边合成边测序的方式,也可称之为高通量测序(next generation sequencing,NGS)。一般都会先把基因组打断,跑胶后选取不同长度的条带进行后续的建库、PCR扩增、测序。第二代高通量
测序仪
主要代表有
Illumina
公司的HiSeq 2000、AB公司的SOLiD和Roche公司的454,其中以Illumina...
在茄科网站得到的基因序列算是通过什么方式得到的
答:
随着高通量测序技术的出现,如
Illumina测序
平台,测序速度大大提高,成本也大幅降低。这些技术利用并行测序的原理,可以同时测序大量的DNA片段,快速生成大量的测序数据。茄科网站往往会提供茄科植物基因组的测序数据,这些数据经过
测序仪器
生成的原始测序数据会经过数据处理和分析,包括序列比对、基因预测、功能...
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