受损最为严重的五所院校分别为：南京大学、浙江大学、厦门大学、武汉大学和中山大学。
1952年的院系大调整旨在将综合性院校进行拆分，将工科专业从中剥离出来，形成新的工科院校。
根据“培养工业建设人才和师资为重点”原则进行工作部署，这样一来，很多学校的元气大伤，不仅教育传承断层，甚至多个院校的优势专业的剥离直接造成学校综合实力的下降。
南京大学在1952年院系调整之前，分为七个院系，文、理、工、农、法、医、师范等七个专业，后来经过调整，只剩下文理两个院系保留，其余五个院系全部剥离。
浙江大学调整之前和南京大学相同，一共七个院系，经过调整最终只剩下工学院的电机专业，不可谓元气大伤，而厦门大学此前坐拥5个学院18个学系，最终也被剥离只剩下文理两科，武汉大学和中山大学情况与之类似，几乎都被剥离成原来的七分之一，甚至更少。
除了这五所元气大伤，伤及根本的知名院校外，还有很多当时的高等名校也深受损伤，例如清华大学，同济大学，南昌大学，广西大学等一系列高等院校，在此之后，多所高校一蹶不振，甚至有部分至今还未恢复。
总体来说，1952年的这次院系改革确实在一定程度上加强了我国的工业力量，为成立初期的新中国培养了相当一部分的人才储备。
甚至，在上个世纪的七八十年代，中国各个领域能有跨越式的发展也与此脱不开关系，但是，因为此次院系改革规模之大，而且侧重之明显，仍然对后来的教育体系产生了一些不好的影响。