南大都是文理综合型大学。纯理科的话，复旦的数学、生物比南大好得多，物理南大相对强一些，化学传统上南大强，但是现在已经和复旦差不多了。其它的比如天文、地理、大气等等纯理科类，都是南大的最强项之一，复旦没有这些专业。浙大的数学很好，和复旦可有一比，其它的纯理学比较一般。
文史类两校不相上下，比如历史、中文、外文等等。博物馆学、国际政治、新闻/广告/传播/广电都是复旦强得多，社会学则是南大强得多，法学两校都很一般。浙大文史类都很一般（因为都是合并前的杭州大学带过来，并不是老浙大）。
经济类两校学术水平差不多，复旦金融更强一些，但是复旦在上海，所以优势很明显。浙大的一般。管理类复旦、浙大比较好，南大差一些。
医学类，复旦合并的原上海医科大学，实力和北医旗鼓相当，因此这3个学校里面毫无争议。浙大合并的原浙江医大，南大则没合并过，浙大比南大相对好不少。
农学类、教育学类，复旦没有，浙大两个都有而且都很好，南大记得也是都没有。
工学类全是浙大的天下。复旦的工科很少不过很精干，微电子在全国顶尖，和清华并列。复旦的高分子、软件都是工科中的强项，国内前5名之内，但是和浙大、南大相比如何不知道。
出国的话，近几年的行情，除掉清华北大，中科大第三，复旦第四，不过今年中科大差不多被复旦赶上了。南大的貌似本校深造的不少。
找工作，同样的专业复旦的优势明显得太多，因为上海的地理优势实在太巨大。南京学校学生很难打进上海各公司，杭州相对还好一些。举个例子，南大学经济的就业情况比上财还要差很多。
论城市综合环境、基建、商业化水平，上海远大于杭州，杭州比南京略强，个人感觉而已。
以上均为个人所了解资料，仅供参考。
希望对你能有所帮助。
浙江大学跟南京大学都是一类大学，都很强
浙江大学
浙江大学，简称“浙大”，坐落于“人间天堂”杭州。前身是1897年创建的求是书院，是中国人自己最早创办的现代高等学府之一。1928年更名为国立浙江大学。中华民国时期，浙江大学在竺可桢老校长的带领下，崛起为民国最高学府之一，被英国学者李约瑟誉为“东方剑桥”，迎来了浙大百年发展史上最辉煌的时期。
浙江大学直属于中华人民共和国教育部，是中国首批7所“211工程”、首批9所“985工程”重点建设的全国重点大学之一，是C9联盟、世界大学联盟、环太平洋大学联盟的成员，是教育部“卓越医生教育培养计划”、“卓越农林人才教育培养计划”改革试点高校，是中国著名顶尖学府之一。
截至2014年底，浙江大学共拥有紫金港、玉泉、西溪、华家池、之江5个校区，占地总面积4.50平方公里，校舍总建筑面积2072303平方米，图书馆藏书671万余册，并有7家附属医院；国家重点一级学科14个，国家重点二级学科21个；一级学科博士学位授权点58个，二级学科博士学位授权点298个，博士后科研流动站52个；本科专业123个，全日制在校学生46364人，其中硕士研究生13952人，博士研究生8779人，本科生23633人。
南京大学：
南京大学，简称南大，是一所源远流长的高等学府。追溯学脉古为源自孙吴永安元年的南京太学，近代校史肇始于1902年筹办的三江师范学堂，历经多次变迁，1949年“国立中央大学”易名“国立南京大学”，翌年径称“南京大学”，沿用至今。
南京大学是教育部与江苏省共建的全国重点大学，国家首批“211工程”、“985工程”高校，首批“珠峰计划”、“111计划”、“2011计划”、“卓越计划”实施高校，也是九校联盟、世界大学联盟、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟的重要成员和东亚研究型大学协会高校。
至2014年底，南京大学有鼓楼、浦口、仙林三个校区，28个直属院系，各类学生总计31304人。全校设本科专业86个，硕士学位授权一级学科18个，博士学位授权一级学科40个，博士后流动站38个，国家级人才培养基地13个；有一级学科国家重点学科8个，二级学科国家重点学科13个，国家重点（培育）学科6个；有国家实验室（筹）1个，国家重点实验室7个，教育部重点实验室8个，国家工程技术研究中心1个，国家级“2011协同创新中心”2个，教育部人文社会科学重点研究基地4个。
南京大学是哈佛大学白碧德主义影响下的中国“学衡派”的雅集地，被誉为“中国科学社的大本营和科学发展的主要基地”，被杨振宁称赞为“中国最顶尖的大学”。南京大学是“985工程”首批九所高水平大学中唯一未合并其他院校的高校，坚持“内涵发展”，保持“原汁原味”办学优势与特色，赢得社会“中国最温和的大学”美誉。
浙江大学好。
在中国内陆校友会的大学排名中，浙江大学是排名在第四的位置，而南京大学排在第五位，浙江大学在综合实力方面还是要比南京大学略胜一筹的。
学科上来看，浙江大学的学科建设要好于南京大学。但是这并不代表南京大学有多差，它们都代表的中国教育的顶尖水平。只是可能术业有专攻，不同学校在不同的方面都有各自的建树。
浙江大学王牌学科简介：
浙江大学是双一流大学，还是百年名校，有很多的王牌专业，其中一级14个国家级重点学科分别是数学、化学、园艺学、机械工程、土木工程、电气工程、光学工程、生物医学工程、控制科学与工程、管理科学与工程、材料科学与工程、植物保护、农业资源利用、动力工程及工程热物理等。
此外，浙江大学设有博士后科研流动站，所涉及的学科更是覆盖面极广，包含了大部分的专业和学科，所以在浙江大学读书和学习还是一个不错的选择。
在所有浙江大学优势王牌专业里面，这些重点一级学科都是值得学的，前提是分数够的情况下。如果是男生的话，可以读工程类的专业，女生可以学园艺学、化学等，但是也要根据自己的兴趣爱好去选择，因为适合自己的才是最好的。
专业老师在线权威答疑 zy.offercoming.com浙江大学的工科 农科比较好
总体实力二者差不多 各种大学排行榜上都是时而南大高点儿时而浙大高点儿 意义不大