上海交通大学医学院附属第九人民医院在社会上产生了深远的影响，其在多个学科领域享有盛誉。作为教育部重点学科，口腔临床医学和整复外科学实力雄厚。口腔颌面外科是上海市和教育部的双重点学科，且是“211工程”建设项目；口腔内科是医学领先和重点学科，尤其在中西医结合黏膜病学方面；口腔修复科和口腔正畸科分别被确立为特色和院级重点学科。整复外科作为我国整复外科学的开创者，是国家“211工程”重点学科，同时也是上海市教委的重点学科。骨科和血管外科也是重点学科，其中骨科在国际和国内享有良好声誉，血管外科在竞争中崭露头角，还被纳入“211工程”外科学学科建设。
医院在设施设备方面投入巨大，拥有先进的CT、MRI、数字化影像系统等，年接待大量患者，包括193万门诊病人和4.1万出院病人，手术量庞大。在临床水平上，口腔颌面外科、整复外科和骨科已达到国际领先水平，为全国知名品牌。医院在科研方面坚持“科教兴院”战略，承担多项国家级和省部级科研项目，包括973首席科学家项目和国家自然科学基金，曾获得国家级奖项，科研论文发表量和被SCI收录数量在全国医疗机构中名列前茅。
在教育方面，九院是上海交通大学口腔医学院的教学基地，设有多个教研室和实训基地，师资力量强大，拥有多个国家级精品课程和教学团队。医院还拥有多个研究中心和实验室，以及多项人才计划支持，培养了众多优秀科研人才。精神文明和政风行风方面，医院荣获多项国家级和省级荣誉，包括思想政治工作先进集体、抗震救灾先进集体等，其口腔颌面外科更是获得了多项国家级劳动奖状和工人先锋号荣誉。
上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院（以下简称“九院”），2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。医院坚持 “以人为本”，从最广大职工利益出发。积极推进医院后勤化改革和劳动人事制度改革；医院重点加大对35岁以下优秀青年的培养力度和考核力度，将启动四期“院优秀人才培养计划”；三期院级重点学科建设项目，重点支持有发展潜力的临床学科。