一、法律规定不同。
房产证是购房者通过交易之后所获得的房屋的合法所有权，购房者依法对于所购房屋行使占有、使用、收益以及处罚的权力。
宅基地证是房产证的条件之一，宅基地允许建房，但建房以前还需要提出申请，经批准之后，才能凭宅基地证以及准建证去申请办理房产证。
二、过户问题
宅基地证是不可以过户的，根据法律，宅基地不能上市交易。房产证可以，房产证可以进行市场交易。
三、对象不同
宅基地证是当前的农村的村民合法所具有房屋以及用地的权力凭证，可以在集体内部成员之间转让，但不患上向非集体组织成员转让。
房产证只能向特定房屋的所有权人发放，如房屋系共有，在房屋所有权证之外，还可向共有权人发放共有权证。
扩展资料：
房产证的特点：
（1）房产证只能由房地产主管机关发放。
（2）房产证是对特定房屋所有权归属的书面证明，并可记载特定房屋共有状况以及是否设定担保物权等状况。基于一物一权主义，房产证以一房屋一房产证为原则，即一个具有独立建筑结构与使用功能的房屋 (包括区分所有的房屋)只有一个所有权，在不动产登记上只能有一项所有权登记，并且据此只能发放一个房产证。
（3）房产证只能向特定房屋的所有权人发放，如房屋系共有，在房屋所有权证之外，还可向共有权人发放共有权证。
（4）房产证是登记机关在对特定房屋权属情况进行登记之后，向特定权利人发放的权属证明，房产证的内容应与登记簿的内容相一致
宅基地证的作用：
宅基地允许建房，但建房之前还需要提出申请，经批准以后，才能凭宅基地证和准建证去申请办理房产证。宅基地证
宅基地地上的房屋等建筑物的确权问题，虽然《物权法》已有相关规定，可以办理房产证，但是，由于宅基地本身的使用限制和建筑物无法与土地分割的实施，造成宅基地相对应的房产证没有实际用途--无法像国有土地上的房产一样，可以抵押、出售以获得其实际收益。
宅基地证，即"集体土地使用证"，但集体土地使用证具有更为广泛的定义，既包括宅基地使用权，还包括其他集体或集体内部成员所使用的集体建设用地使用权证明，如:村办学校、办公室、村办企业等等。
集体建设用地使用权是与国有建设用地使用权相对应的，区别在于使用权的权限:集体土地未经批准不得转让、出售，使用权人只能是本集体组织内部成员;而国有建设用地就没有上述相关的规定。
参考资料：百度百科-房产证
参考资料：百度百科-宅基地使用证