深海鱼油的主要功能为降低胆固醇，预防血管疾病。EPA被称为"血管清道夫"，它具有疏导清理心脏血管的作用，从而防止多种心血管疾病。
而DHA是大脑细胞形成发育及运作不可缺少的物质基础，同时也能对活化衰弱的视网膜细胞有帮助，从而起补脑健脑以及提高视力，防止近视眼的作用。
此外，DHA还是母乳中必要成分，能增强人体免疫能力。深海鱼油适用病症包括高血压、高胆固醇、高血脂、脑血管障碍、心肌梗塞、动脉硬化、青光眼、白内障等。
宣传资料上说得神乎其神的功效迷惑了众多消费者，但专业营养医师对其的解释却与之自夸的说法大相径庭。
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